ネットで検索したら悪い噂が多数出てきました。そういう本部は危険ですか？

鵜呑みにしないほうがよいでしょう。自分で確認するほうが納得できます。

加盟を検討している本部がそのような状況であれば、うやむやにせず真実かどうかを直接聞いてみましょう。「火のないところに煙は立たず」という見方もありますが、悪徳な同業他社が嫌がらせで書き込むケースもないわけではありません。ただ、デリケートな話題なので聞き方には配慮を。相手の立場を尊重する姿勢を忘れてはなりません。
「失礼がないように聞いたにもかかわらず相手が怒るのであれば、ご縁がなかったと思うほうがいいかもしれません」（FC関係者）

同時に、先輩オーナーに話を聞いてみるなど様々な手段を使って自分で確認すれば、納得しやすいのではないでしょうか。